Các nhà phê bình của kinh tế học hành vi thường nhấn mạnh tính hợp lý của các tác nhân kinh tế.[41] Họ cho rằng hành vi được quan sát bằng thực nghiệm đã hạn chế áp dụng cho các tình thế thị trường, như các cơ hội học tập và cạnh tranh đảm bảo ít nhất một ước lượng gần xấp xỉ hành vi hợp lý.

Những người khác lưu ý rằng các lý thuyết nhận thức, chẳng hạn như lý thuyết triển vọng, là các mô hình của ra quyết định, không tổng quát hóa hành vi kinh tế, và chỉ có thể áp dụng cho các loại vấn đề ra quyết định một lần được trình bày cho đối tượng tham gia thí nghiệm hoặc khảo sát.

Các nhà kinh tế truyền thống cũng hoài nghi về các kỹ thuật thực nghiệm và dựa trên khảo sát mà kinh tế học hành vi sử dụng rộng rãi. Các nhà kinh tế thường nhấn mạnh các ưu tiên tiết lộ trên các ưu tiên tuyên bố (từ các cuộc điều tra) trong việc xác định giá trị kinh tế. Các thí nghiệm và các cuộc điều tra có nguy cơ của các thiên vị hệ thống, hành vi chiến lược và thiếu tính tương thích khuyến khích.

Rabin (1998)[42] bác bỏ những lời chỉ trích này, cho rằng các kết quả phù hợp thường thu được trong nhiều tình huống và khu vực địa lý và có thể tạo ra cái nhìn sâu sắc lý thuyết tốt. Các nhà kinh tế học hành vi cũng đã phản ứng với những lời chỉ trích bằng cách tập trung vào nghiên cứu lĩnh vực chứ không phải là phòng thí nghiệm. Một số nhà kinh tế nhìn thấy một ly giáo cơ bản giữa kinh tế học thực nghiệm và kinh tế học hành vi, nhưng các nhà kinh tế hành vi và thực nghiệm nổi tiếng có xu hướng chia sẻ các kỹ thuật và phương pháp tiếp cận trong việc trả lời các câu hỏi chung. Ví dụ, các nhà kinh tế hành vi đang tích cực điều tra kinh tế học thần kinh, đó là hoàn toàn thực nghiệm và chưa được xác nhận trong lĩnh vực này

Những người ủng hộ khác của kinh tế học hành vi lưu ý rằng các mô hình tân cổ điển thường không dự đoán kết quả trong bối cảnh thế giới thực. Hiểu biết sâu sắc về hành vi có thể ảnh hưởng đến các mô hình tân cổ điển. Các nhà kinh tế hành vi lưu ý rằng các mô hình sửa đổi này không chỉ đạt được những dự báo chính xác giống như các mô hình truyền thống, mà còn dự đoán chính xác một số kết quả mà các mô hình truyền thống thất bại.